水质自动监测系统仪表分析单元、取水单元、配水单元、控制系统、数据采集/处理/传输系统、防雷设备组成。其中仪表分析单元由五参数分析仪、COD分析仪、总磷分析仪、氨氮分析仪、总氮分析仪等组成；采水系统将水样采集预处理后供各分析仪表供各分析仪使用；系统泵阀及辅助设备由PLC 控制系统统一进行控制；各仪表数据经RS232/485 接口由数采工控设备进行统一数据采集和处理，系统数据有线光纤或4G无线传输两种传输模式。为防止雷击影响，水质自动监测系统配置完善的防直击雷和感应雷措施。系统配置智能环境监控单元对系统整体、消防和动力配电进行智能监控。

水站采用集成式设计原理，包含采配水系统、检测单元（总磷、总氮、高锰酸盐指数、氨氮、常规五参数五个测量模块）、质量控制单元、辅助单元（废液收集、防雷、空调等）。其中核心单元为检测单元，总磷、总氮、COD、氨氮严格遵循规定的化学分析方法。常规五参数指标（溶解氧、电导率、浊度、温度、pH）采用多电极集成方式进行测量，多余的源水和样水经总排水管道排出。

配水系统采用空压机高压冲洗方式对采样管路进行反吹和反清洗，确保管路清洁。